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Il microscopio è uno strumento che consente di risolvere e ingrandire oggetti di piccole dimensioni per permetterne l'osservazione diretta, o indiretta tramite fotografia e sistemi elettronici.
Il microscopio ottico e basato sull'osservazione nell'ambito dello spettro elettromagnetico della luce visbile I primi strumenti efficaci, nell'ambito dei microscopi di tipo ottico, vennero prodotti in Olanda alla fine del XVI secolo, ma l'invenzione vera e propria è tuttora.
Galileo definiva lo strumento un "occhialino per vedere le cose minime".
Tra i primi scienziati ad utilizzare, diffondere e migliorare l'uso di questo potente strumento si ricordano Antoni van Leeuwenhoek e Robert Hooke.